Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms