Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis18aQ9CZJ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis18aQ9CZJ6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms