Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd11Q9CZG9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd11Q9CZG9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms