Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Exo5Q9CXP9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo5Q9CXP9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms