Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem50aQ9CXL1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms