Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alpk1Q9CXB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Alpk1Q9CXB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alpk1Q9CXB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms