Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc43Q9CR29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms