Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS4

Slc25a46, Solute carrier family 25 member 46, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a46Q9CQS4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc25a46Q9CQS4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc25a46Q9CQS4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc25a46Q9CQS4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms