Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9CQC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms