Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMCQ9BYG8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms