Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF1Q9BXJ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF1Q9BXJ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms