Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS2Q9BXC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms