Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRA6Q9BX79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms