Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms