Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim11Q99PQ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim11Q99PQ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim11Q99PQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms