Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rrbp1Q99PL5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rrbp1Q99PL5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Rrbp1Q99PL5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rrbp1Q99PL5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rrbp1Q99PL5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rrbp1Q99PL5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rrbp1Q99PL5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rrbp1Q99PL5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms