Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpgs1Q99MS8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpgs1Q99MS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms