Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BrapQ99MP8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms