Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smtnl1Q99LM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smtnl1Q99LM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms