Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ophn1Q99J31 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms