Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNQ99608 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNQ99608 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNQ99608 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNQ99608 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNQ99608 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNQ99608 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNQ99608 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNQ99608 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNQ99608 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNQ99608 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms