Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms