Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD4Q96M96 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms