Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C8orf48Q96LL4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.2 ms