Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms