Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
COG3Q96JB2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms