Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3KBP1Q96B97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms