Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col20a1Q923P0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col20a1Q923P0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms