Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf3Q922U1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms