Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms