Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims2Q91XD2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims2Q91XD2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms