Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF12Q8WXF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms