Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Smg8Q8VE18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg8Q8VE18 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms