Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fam20bQ8VCS3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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