Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms