Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk8Q8R3L8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk8Q8R3L8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms