Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms