Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Shtn1Q8K2Q9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shtn1Q8K2Q9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms