Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh3Q8K1E6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alkbh3Q8K1E6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh3Q8K1E6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh3Q8K1E6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh3Q8K1E6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh3Q8K1E6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh3Q8K1E6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms