Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700001C19RikQ8K168 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700001C19RikQ8K168 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700001C19RikQ8K168 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700001C19RikQ8K168 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms