Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HACE1Q8IYU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms