Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPA2Q8IWL1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms