Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC83Q8IWF9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms