Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClasrpQ8CFC7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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