Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28bQ8CEG5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28bQ8CEG5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms