Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4f1Q8CCE9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E4f1Q8CCE9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms