Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cwc22Q8C5N3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cwc22Q8C5N3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms