Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrd1Q8C0R9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrd1Q8C0R9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrd1Q8C0R9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms