Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek11Q8C0Q4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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