Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcl3Q8BVF2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms